Codename: Gordon

Nom de code : Gordon présente une alternative à l'histoire de Half-Life 2, avec des emplacements inspirés à la fois par Half-Life et Half-Life 2. En chemin, Gordon Freeman — le protagoniste des jeux canon — rencontre certains des personnages principaux de la série Half-Life et tente de trouver ce qui a causé la disparition de la troisième dimension. Le jeu commence avec Gordon Freeman dans une zone de quai. Après avoir traversé quelques zombies et headcrabs, Gordon rencontre Barney Calhoun, un personnage important dans les titres de Half-Life. Il raconte à Gordon qu'il manque une « dimension entière » et note également que l'équipe scientifique travaille à résoudre le problème. Blessé, Barney ne peut pas quitter l'endroit, donc il donne son pistolet à Gordon, lui disant de partir sans lui. Dans le deuxième chapitre, le joueur rencontre Eli Vance et sa fille Alyx qui disent à Gordon de prendre leur voiture, ce qui l'aidera à atteindre la ville 17, car apparemment c'est le centre du problème. Ils lui disent aussi de parler au Dr Kleiner de sa nouvelle invention, le pistolet à gravité. Peu de temps après, le joueur retrouve le Dr Kleiner, qui parle à Gordon de ses inquiétudes concernant la dimension manquante et lui donne également le pistolet à gravité mentionné par Eli et Alyx. Après avoir été attaqué par un vaisseau extraterrestre et avoir passé une prison lourdement gardée par les soldats de Combine, Gordon parvient à atteindre la ville 17, où il trouve le G-Man. Il dit au joueur qu'il l'attendait et prétend ne pas être derrière la situation concernant la dimension manquante, au lieu de dire qu'il n'est qu'un « pion faible dans un jeu ombragé joué par des puissances sinistres ». Peu de temps après, Gordon affronte un strider — une grande unité d'assaut de trépieds — qui s'avère être la source du problème, car en le battant un portail est ouvert; en entrant dans ce portail, Gordon est renvoyé à la troisième dimension.