Mega Man Zero

Plus d'un siècle après la défaite de Sigma dans la série Mega Man X, un nouveau gouvernement appelé Neo Arcadia a été formé pour maintenir la paix. Les dirigeants de Neo Arcadia ont commencé à chasser les Reploïdes injustement les qualifier de Mavericks. Maintenant le seul espoir pour le Reploïde est un légendaire Reploïde : le Héros Rouge qui s'appelle Zéro. Sentant que les Reploïdes étaient accusés à tort, Ciel fuit Neo Arcadia et crée une Résistance contre Neo Arcadia. Le jeu commence comme Ciel et un petit groupe de soldats résistants est chassé par Pantheons et Golems. Certains soldats de la résistance prennent du retard, mais ils ne peuvent pas arrêter leur avance. Poursuivant, Ciel atteint une énorme porte. Passy, son Cyber-elf dit : « Je ressens une forte énergie qui émane d'ici. Ce doit être l'endroit." Après cela, les soldats font sauter la porte, et Ciel, Passy et Milan entrent dans la pièce, avec le corps sans vie de Zéro au milieu de la pièce, inactif pendant 100 ans. Milan essaie de le toucher, mais il est renversé par un bouclier énergétique qui protège Zéro. Pendant qu'ils essaient de trouver comment contourner le bouclier, Pantheons apparaissent à la porte. Milan ordonne à Ciel de courir, de mourir, d'être frappé par l'un des Panthéons. Passy dit à Ciel: "Vous devez utiliser mon pouvoir. Vous n'avez pas le choix." Ciel pense pendant que Pantheons se rapproche et s'accorde tristement. Le sacrifice de Passy brise le bouclier énergétique et ramène Zéro à la vie. Il aide Ciel, et apprend que Mega Man X (bien qu'en fait une copie) est le responsable de l'innocente Reploïdes à la retraite.