Mega Man Zero 3

Avec la Résistance de Ciel, il a vaincu Copy X, le chef de Neo Arcadia. La terreur du régime néo-arcadien a pris fin, mais la pénurie d'énergie demeure un problème constant. Ciel s'est consacrée à la recherche de nouvelles formes d'énergie. Et Elpizo est devenu le nouveau chef de la Résistance. Mais vaincu par son désir de pouvoir, Elpizo a réveillé l'elfe sombre, dont la magie avait déjà presque détruit le monde. Elpizo, assoiffé de la puissance de l'Elfe Noir, perdit de vue son vrai devoir, et a finalement été vaincu après une bataille féroce. Cependant, l'elfe sombre a fui, sa destination inconnue... La bataille sur l'elfe noire venait de commencer. Deux mois après les événements de Mega Man Zero 2, un vaisseau spatial qui s'est écrasé récemment émet de l'énergie similaire à l'elfe sombre. Zero, Ciel et une paire de membres de la Résistance se sont mis à enquêter. Peu après dans la mission Ciel et les deux membres de la Résistance sont capturés par Neo Arcadia alors que Zero entre dans le navire. Cependant, ils ne sont pas lésés, et ils ne sont pas détenus, car un incident éclate impliquant un géant Reploïde nommé Omega que même Léviathan et Fefnir combinés ne peuvent pas gérer. Zéro interrompt la bataille et est laissé à tout seul. Peu de temps après, le Dr Weil est présenté, avec une copie X apparemment ressuscitée dans le remorquage, qui reprend alors la direction de Neo Arcadia, beaucoup au regret de Harpuia.