Strawberry Panic! Girls' School in Fullbloom

L'intrigue de Strawberry Panic ! tourne autour de la vie des adolescents qui fréquentent l'une des trois écoles de filles affiliées qui partagent un campus et des dortoirs. Les écoles sont : St. Miator's Girls' Academy, St. Spica's Girls' Institute et St. Lulim's Girls' School. Il y a douze personnages autour de l'histoire, quatre à chaque école. Le personnage principal de l'histoire est Nagisa Aoi, une jeune fille entrant sa quatrième année à St. Miator après avoir été transférée d'une autre école. En entrant d'abord sur le terrain du campus, elle est surmontée de joie par l'aspect général de la région environnante, mais sa joie est bientôt transformée en peine alors qu'elle tombe accidentellement sur une colline, la faisant perdre et désorienter. Tout en marchant dans les terrains essayant de travailler où elle est, Nagisa rencontre une étudiante plus âgée nommée Shizuma Hanazono, qui se trouve être Etoile d'Astraea Hill, une personne très importante qui agit comme un représentant entre les différentes écoles et a des devoirs spécifiques qu'elle doit remplir. Nagisa est instantanément surmontée par la beauté de Shizuma, et après que Shizuma l'a embrassée sur le front, Nagisa perd conscience et se réveille dans l'infirmerie de l'école. Dans une chaise adjacente est une autre fille du même âge, Tamao Suzumi, qui l'informe qu'ils doivent être colocataires dans le dortoir.