Syphon Filter 2

Quelques heures après les événements du premier match, Gabriel Logan et Lian Xing sont des ennemis de l'État à l'Agence après avoir découvert son lien avec Syphon Filter, qualifié de terroriste au grand public. L'agent de l'agence Dillon Morgan capture Lian dans les entrepôts de PharCom, forçant Gabe et les soldats de la CBDC à se retrouver avec l'ex-agent de l'agence Teresa Lipan en Arizona. Simultanément, l'Office brouille un escadron de rapaces F-22 pour intercepter leur transport au-dessus des Rocheuses du Colorado. Gabe et le lieutenant Jason Chance du CBDC se dirigent vers la montagne, à la recherche de leur avion et d'une boîte de disques PharCom. L'agent de l'agence Steven Archer essaie de les arrêter à tout prix. Un groupe de conspirateurs, dont Mara Aramov et le directeur de l'Agence Lyle Stevens, font un marché pour livrer le virus à un général chinois voyou nommé Shi-Hao. Pendant ce temps, Lian se rétablit dans une base de l'armée de l'air américaine où Morgan, Derek Falkan et Thomas Holman travaillent avec le Dr Elsa Weissinger de PharCom pour extraire le plasma infecté des sujets testés. Lian apprend que l'autre sujet était le PDG de PharCom Jonathan Phagan, qui a survécu à sa blessure par balle assez longtemps pour que l'Agence prenne le plasma. Weissinger proteste contre l'utilité de Phagan et devrait être maintenu en vie pour de plus amples recherches. Cependant, Morgan, n'ayant pas l'intention que le gouvernement américain trouve le PDG de Pharcom infecté par un virus inconnu, désactive son soutien de vie, resserrant une fin lâche. Lian s'échappe du bâtiment médical et interroge Holman pour apprendre que Morgan planifie une autre opération au PharCom Expo Center pour trouver un disque de chiffrement. Après avoir tué Falkan, elle quitte la base en hélicoptère et fait équipe avec Gabe pour combattre les forces d'Archer. Gabe tire sur Archer pendant son évasion et récupère les données de PharCom. Les protagonistes suivent Holman à l'Expo Center et tuent Morgan avant de pouvoir récupérer le disque qu'il cherchait. Après avoir déchiffré les données de PharCom, Teresa réalise que certaines informations manquent. L'autre moitié doit être avec le réalisateur russe SVR Uri Gregorov, qui est apparu dans les entrepôts avant le départ de Gabe. Puisque Lian et Uri se connaissent, ils acceptent de se rencontrer à Moscou. Aramov provoque une fusillade pendant qu'ils se rencontrent, et Lian poursuit Gregorov. Lian apprend plus tard qu'il est un imposteur travaillant pour Mara et essayant de trouver l'autre moitié des données. L'homme admet que le vrai Gregorov est dans un goulag russe, la prison d'Aljir, qui a autrefois détenu Lian captive. Gregorov a découvert une parcelle pour vendre le virus à Shi-Hao, donc Aramov est intervenu. Lian arrête l'exécution de Gregorov mais est presque tué par le virus et s'effondre. Gabe la ramène aux États-Unis, tandis que Gregorov promet de gérer Shi-Hao. Gabe et Teresa retournent au refuge de Virginie supervisé par Lawrence Mujari, pathologiste freelance. Ils ont échangé les données de PharCom avec l'Agence pour le vaccin de Lian. Le directeur Stevens double Gabe dans les laboratoires de New York de l'Agence, mais Logan s'échappe et force le Dr Weissinger à lui donner le vaccin. Gabe découvre également que Chance a survécu à la mission au Colorado, qui le libère. Poursuivi par les policiers de NYPD SWAT et le personnel de l'Agence, Gabe se précipite vers leur hélicoptère. En chemin, Logan est obligé de couvrir un officier du SWAT dont le partenaire est blessé. Il le fait, mais Stevens, qui plus tard prend le flic en otage, lui ordonne de lâcher ses armes. Malgré le respect de Logan à la reddition, Stevens tue l'officier de toute façon. Avant de se faire tirer dessus, Gabe est jeté dans les égouts par une explosion que Teresa déclenche. Gabe suppose que Chance a été tué dans les laboratoires puisque Teresa dit qu'il n'est jamais arrivé à l'hélicoptère. Gabe et Teresa finissent par coincer Stevens, et Gabe lui tire dans le sang froid. Gabe et Teresa arrivent à l'hélicoptère pour trouver Chance dans un blindage impénétrable émis par l'Agence. Il travaillait pour eux, et il tire sur Teresa. Gabe le soupçonnait puisque l'Agence avait toujours su où il se trouvait au Colorado. Les deux hommes se battent, et Gabe tue l'homme de confiance avec un fusil d'assaut qui conduit Chance dans les pales de l'hélicoptère, le décapitant. Un reportage révèle que l'existence de l'Agence est maintenant publique, et le secrétaire d'État américain Vincent Hadden promet que le gouvernement enquêtera. Gabe guérit Lian et délimite une tombe pour Teresa. Lui, Lian et Lawrence tiennent un petit mémorial et promettent de continuer à combattre pendant que les soldats les regardent de loin. Dans une scène post-crédits, Hadden et Aramov émergent d'un hélicoptère, avec Aramov disant que l'Administration va bientôt tomber, permettant à Hadden de devenir président. Bien qu'une équipe de soldats demande la permission de tuer Gabe et son équipe, Hadden annule l'opération, disant à Mara qu'il a d'autres plans pour Gabe. Aramov rit alors que l'écran se fane en noir.